گاهی اوقات سطح خورشید دارای نقاط تاریک است که به آنها لکه های خورشیدی می گویند. مناطقی با میدان های مغناطیسی پوشانده شده و تاریک به نظر می رسند زیرا از مناطق اطراف خنک تر هستند. لکه های خورشیدی در چرخه های 11 ساله ظاهر می شوند. در نیمه راه هر چرخه در زمانی که حداکثر خورشیدی نامیده می شود، لکه های خورشیدی زیادی می بینیم. سپس آنها به تدریج در طی پنج سال کاهش می یابند تا زمانی که لکه های خورشیدی کمی وجود داشته باشد. این حداقل خورشیدی نامیده می شود. لکه‌ها به فعالیت خورشیدی مربوط می‌شوند، به‌ویژه در طغیان‌های درخشانی که شراره‌ها نامیده می‌شوند. انفجارهای خورشیدی دیگر، به نام پرتاب جرم تاجی، توده های عظیمی از گازهای پرانرژی را به فضا پرتاب می کنند. این انفجارها اغلب در طول دوره حداکثر فعالیت خورشیدی رخ می دهند و باعث ایجاد پدیده ای به نام هوای فضا می شوند که در سراسر منظومه شمسی رخ می دهد.